Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP3P42574 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP3P42574 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP3P42574 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP3P42574 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP3P42574 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP3P42574 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP3P42574 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms