Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBRP36941 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms