Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA10P31260 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA10P31260 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA10P31260 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms