Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRMP28827 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRMP28827 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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