Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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HOXD10P28358 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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HOXD10P28358 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
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HOXD10P28358 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD10P28358 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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