Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD1P28340 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD1P28340 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD1P28340 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms