Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms