Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms