Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms