Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A1P11836 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms