Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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