Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRR35P0CG20 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms