Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY75O60449 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LY75O60449 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LY75O60449 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY75O60449 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LY75O60449 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY75O60449 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY75O60449 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY75O60449 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY75O60449 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY75O60449 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY75O60449 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY75O60449 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY75O60449 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY75O60449 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY75O60449 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms