Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD28O15084 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms