Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms