Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPA5E9PKD4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms