Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00587B1AMM8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms