Protein–RNA interactions for Protein: A6NGE7

URAD, Putative 2-oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URADA6NGE7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URADA6NGE7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
URADA6NGE7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms