Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L4A6NEF3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms