Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms