Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDRG3Q9UGV2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms