Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms