Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf78Q9NZ63 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms