Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PGPEP1Q9NXJ5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms