Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms