Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AP000941.1-201ENST00000530198 1388 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 TBC1D3P4-201ENST00000338790 1075 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 RPL23AP49-202ENST00000638439 1138 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 RPL5P28-201ENST00000418634 693 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 RN7SKP52-201ENST00000516219 250 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC097478.3-201ENST00000620420 872 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms