Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms