Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC106Q9BWC9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms