Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF2Q99805 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms