Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPA33Q99795 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms