Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX18Q96RF0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms