Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms