Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 IL22-202ENST00000538666 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL360268.1-201ENST00000453870 765 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL133330.1-201ENST00000510619 704 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC104123.1-203ENST00000513158 575 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms