Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms