Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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GTF3C6Q969F1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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GTF3C6Q969F1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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GTF3C6Q969F1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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