Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms