Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AVL9Q8NBF6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms