Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3Q6VB84 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms