Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms