Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms