Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms