Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MICAQ29983 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms