Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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