Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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ALX1Q15699 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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