Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms