Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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BRD3Q15059 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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BRD3Q15059 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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BRD3Q15059 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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BRD3Q15059 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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BRD3Q15059 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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BRD3Q15059 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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