Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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