Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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FAT1Q14517 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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FAT1Q14517 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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FAT1Q14517 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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FAT1Q14517 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT1Q14517 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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