Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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