Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE4AQ14139 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE4AQ14139 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE4AQ14139 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE4AQ14139 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE4AQ14139 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE4AQ14139 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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